JabRef 是一個整理文獻的工具程式，有跨平台的各個版本，由開放源碼社群製作維護。目前版本是 2.6。下載最近的穩定版本，安裝。
在開始建立文獻資料庫之前，要先設定幾項事情 (選單 Option > Preferences)。
文字編碼要設成 unicode 的 UTF8。
字體設成中文字體 PMingLiU (在 Windows 平台)。
文獻代碼 (Bibkey) 產生器作如下的設定：
以下是各種類型文獻的代碼格式範例：
| 文獻類別： | Article |
| 完整資料： | H. W. Deckman and J. H. Dunsmuir, “Natural lithography,” Appl. Phys. Lett., vol. 41, pp. 377–379, 1982. |
| 希望產生的 Bibkey： | apl_41_377_1982_deckman |
| 指令： | [journal:abbr:lower]_[volume]_[firstpage]_[year]_[auth:lower] |
| 文獻類別： | Book |
| 完整資料： | E. F. Schubert, Light Emitting Diodes, Cambridge University Press, 2003. |
| 希望產生的 Bibkey： | bk_light_2003_schubert |
| 指令： | bk_[veryshorttitle:lower]_[year]_[auth:lower] |
| 文獻類別： | InBook |
| 完整資料： | F. M. Steranka, AlGaAs Red Light-Emitting Diodes, vol. 48 of Semiconductors and Semimetals, High Brightness Light Emitting Diodes, ch. 3, pp. 65–96. Academic Press, 1997. |
| 希望產生的 Bibkey： | bk_algaas_ch3_1997_steranka |
| 指令： | bk_[veryshorttitle:lower]_ch[chapter]_[year]_[auth:lower] |
| 文獻類別： | Inproceedings |
| 完整資料： | N.-P. Chen, M.-H. Chou, C.-C. Wang, C.-J. Hsieh, Y.-C. Chan, and S.-J. Kuo, “The design of the multiple resonance microcavity by reflection phase manipulation of non-QWS DBR for OLED chromaticity enhancement,” in Proc. SPIE Org. Light Emit. Mat. Devices XIII, vol. 7415, pp. 74151K-1–74151K-8, San Diego, CA, USA, August 2009. |
| 希望產生的 Bibkey： | proc_psolemdx _2009_chen |
| 指令： | proc_[booktitle:abbr:lower]_[year]_[auth:lower] |
| 文獻類別： | Manual |
| 完整資料： | Agilent, HP4156 User’s Manual, 2001. |
| 希望產生的 Bibkey： | manual_hp4156 |
| 指令： | manual_[veryshorttitle:lower] |
| 文獻類別： | Master Thesis / PhD Thesis |
| 指令： | thesis_[veryshorttitle:lower]_[year]_[auth:lower] |
| 文獻類別： | Patent |
| 完整資料： | H. Sugawara, M. Ishakawa, Y. Kokubun, Y. Nishikawa, S. Naritsuka, K. Itaya, G. Hatakoshi, and M. Suzuki, “Semiconductor light-emitting device,” U.S. Patent No. 5153889, 1992. |
| 希望產生的 Bibkey： | pat_us_5153889_1992_sugawara |
| 指令： | pat_[nationality:lower]_[number]_[year]_[auth:lower] |
| 文獻類別： | Tech. Report |
| 指令： | rep_[veryshorttitle:lower]_[year]_[auth:lower] |
中文的書、論文，依上述代碼格式指令會得到含中文字串的代碼，無法用於 BibTeX。遇此情形，建議自行修改所得的代碼，以英文字串代換。
